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中國領銜全球**大植物基因測序 水稻育種由手工篩選走向精準設計
迄今全球**大植物基因測序項目“3000份水稻基因組研究”26日結出碩果——北京時間當天凌晨1點,,國際****學術期刊《自然》正式發(fā)表《3010份亞洲栽培稻基因組研究》,;由中國主導的此項國際間科研大協(xié)作,針對水稻起源,、分類和馴化規(guī)律進行了深入探討,,揭示了亞洲栽培稻的起源和群體基因組變異結構,剖析了水稻核心種質(zhì)資源的基因組遺傳多樣性,。這一重大成果將推動水稻規(guī)?;虬l(fā)掘和水稻復雜性狀分子改良,提升全球水稻基因組研究和分子育種水平,,使水稻育種由傳統(tǒng)的手工篩選走向基于大數(shù)據(jù)的精準設計,。
該項目首席科學家、中國農(nóng)科院作科所研究員黎志康表示,,過去和未來的育種成果都取決于我們對種質(zhì)資源遺傳多樣性的利用,;全球一共保留了78萬份水稻種質(zhì)資源,弄清核心種質(zhì)資源的基因組的多樣性,,包括所有基因的等位基因及其各種各樣的變異,,能夠為未來的水稻品種改良建立永久的、基于水稻功能基因組信息的數(shù)據(jù)庫和應用平臺,。
他介紹,,項目經(jīng)嚴格的分層取樣法,選取源于全球89個國家的3010份水稻種質(zhì),,代表了78萬份中95%以上的遺傳多樣性,。研究發(fā)現(xiàn)了
2900萬份新的SNPs(單核苷酸多態(tài)性),相當于在水稻基因組中加進了2900萬個標簽,給基因育種提供了精確導向,;恢復了秈稻,、粳稻的命名;完成了對栽培稻**精細的種群分類:九個群體,,包括4個秈稻亞群,、3個粳稻亞群及Aus、Aro,;發(fā)現(xiàn)了豐富的基因組結構變異,,包括易位、倒位,、重復和缺失,;確定了全球首個近于完整的、高質(zhì)量的農(nóng)作物-亞洲栽培稻的泛基因組,。
國際水稻研究所首席科學家,,國際水稻基因庫主任R·S·漢密爾頓博士評價說,“過去從一個性狀發(fā)現(xiàn)到品種育成需要近40年,,現(xiàn)在利用這些信息短短幾年就可以實現(xiàn)”,。此外,該項研究還可以使育種過程更加高效和精確,,使育成品種減少對環(huán)境的影響,,低投入高產(chǎn)出,以及適應消費者不斷變化的需求,。
該項研究由中國農(nóng)科院作科所牽頭,,聯(lián)合國際水稻研究所,、華大基因,、上海交大、深圳農(nóng)業(yè)基因所,、安徽農(nóng)大,、美國亞利桑那大學等16家機構共同完成,并得到中國科技部,、農(nóng)業(yè)農(nóng)村部,、國家自然基金委及美國蓋茨基金會支持。
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